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Accueil > Plateforme Protéomique

Plateforme

publié le , mis à jour le

La plateforme de protéomique de l’Unité a vu son label IBiSA (Infrastructures en Biologie Santé et Agronomie) renouvelé deux fois en 2010 et en 2013 et est un des sites du TGE FT-ICR.

La plateforme a également été labellisée plateforme du SIRIC (Site de Recherche Intégrée sur le Cancer) de Lille en 2013. Elle est ouverte à l’ensemble des équipes de recherche de l’Université de Lille et dans la mesure de ses possibilités, aux équipes extérieures à l’Université.

Trois types de services sont offerts par la plateforme :

  • l’accès direct aux instruments
  • la réalisation d’analyses dont nous ne prenons pas en charge l’interprétation
  • les collaborations qui représentent souvent des projets de plus grande ampleur.

La plateforme possède différents logiciel d’analyse MASCOT Distiller, Proteome discover, PEAKS 7, Proteome deconvolution, la suite de logiciel pour les MALDI TOF et TOF-TOF, le FT-ICR. Ainsi qu’un serveur avec les bases de données Swissprot, NCBi mais aussi des bases de données internes.

L’objectif de la Plateforme de Protéomique est de mettre à disposition des équipes qui s’adressent à elle un équipement, une compétence scientifique et un savoir-faire adaptés aux questions posées, depuis les plus simples (identification de protéines provenant d’un organisme entièrement séquencé) jusqu’aux plus complexes (quantification des variations, dynamique des modifications post-traductionnelles,...), dans le cadre de collaborations et de prestations.

La plateforme réalise :

  • Identification de protéines par digestion enzymatique
  • Quantification de protéine par méthode Label Free ou SILAC
  • Analyse de protéines intactes
  • Analyse de modifications post-traductionelles (phosphorylation, glycosylation...)
  • Enrichissement en phospho ou glycopeptides / proteines

    Les modalités d’accès à la plate-forme et les tarifs des différentes prestations sont disponibles ici

Tarifs