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Accueil > Plateformes > Plateforme protéomique

Protéomique

par Fabrice BRAY - publié le , mis à jour le

La plateforme de protéomique dirigé par le Dr Bray Fabrice (IE) de l’Unité a vu son label IBiSA (Infrastructures en Biologie Santé et Agronomie) renouvelé deux fois en 2010 et en 2013 et est un des sites du TGE FT-ICR.

La plateforme est ouverte à l’ensemble des équipes de recherche de l’Université de Lille et dans la mesure de ses possibilités, aux équipes extérieures à l’Université.

Deux types de services sont offerts par la plateforme :

  • l’accès direct aux instruments
  • les collaborations qui représentent souvent des projets de plus grande ampleur.

La plateforme possède différents logiciels d’analyse MASCOT Distiller, Proteome discover, PEAKS 7, Proteome deconvolution, Maxquant, Skyline, la suite de logiciel pour les MALDI TOF et TOF-TOF, le FT-ICR. Ainsi qu’un serveur avec les bases de données Swissprot, NCBi mais aussi des bases de données internes.

L’objectif de la Plateforme de Protéomique est de mettre à disposition des équipes qui s’adressent à elle un équipement, une compétence scientifique et un savoir-faire adaptés aux questions posées, depuis les plus simples (identification de protéines provenant d’un organisme entièrement séquencé) jusqu’aux plus complexes (quantification des variations, dynamique des modifications post-traductionnelles,...), dans le cadre de collaborations et de prestations.

La plateforme réalise :

  • Identification de protéines par digestion enzymatique à partir d’échantillons variés (poudre, liquide, os, tissue, plasma, gel...)
  • Quantification de protéine par méthode Label Free, SILAC, TMT.
  • Quantification ciblée avec l’utilisation de peptides AQUA et de la méthode PRM.
  • Analyse de protéines intactes.
  • Analyse de modifications post-traductionelles (phosphorylation, glycosylation...)
  • Enrichissement en phospho ou glycopeptides / protéines avec utilisation de colonne à façon.
  • Analyse d’échantillons d’héritage culturel, d’archéologie ou paléontologie.
  • Analyse de lipides comme les triacylglycéroles ou de métabolomique.
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    Les modalités d’accès à la plate-forme et les tarifs des différentes prestations sont disponibles ici
    contact : msap-plateformes@univ-lille.fr